Під час допитів йому інкримінували звʼязки з ФСБ. Офіційно жодних звинувачень йому не висували.
«Фізичного впливу на мене не здійснювали, за винятком викрадення на самому початку, проте казали, що можна зникнути зовсім, якісь слова про «рити яму». Ми всі розуміємо, про що йдеться».
Після 9 днів затримання Каплунова відвезли назад до його будинку. На його думку, метою цих дій була дискредитація «Спецпідрозділу Тимура» ГУР МО.